受到誅滅籠邀請之后，栗木橘成為了裁決者第九支隊的隊長，而成員擁有凰羽杏，迷生櫻，半月梨，兔尾桃，同時他們也得到了來自裁決者的技術(shù)支持，實力更上一層樓。
并且成為了新支隊之后他們也有了任命預(yù)備裁決者的權(quán)利，在眾人一同決定下，目錄中的A級蛋殼的魔法少女加入了他們的預(yù)備隊伍。同時他們也擁有了專屬的后勤魔法少女，他們挑選了一位甜食的魔法少女，以及一位飛翔的魔法少女。
引入二階變身系統(tǒng)，通過將生命容器覆蓋全身的方式增強魔力，代價是以百年計算的壽命會瞬間以小時為單位計算，并且每遭受一次攻擊生命容器都會被直接損傷，正常來說S級魔法少女是被禁止使用二階變身的。
自此之后他們第九支隊也迎來了第一個任務(wù)，處決位于青嵐市的死亡的魔法少女夜神嵐。
【第二卷】裁決之卷。
夜神嵐原本是有一位姐姐的，是一位出色的魔法少女，為人類做出了很多貢獻，但最后被一位人類殘忍的殺害，自此之后，夜神嵐就走上了審判人類的道路。
栗木橘陪迷生櫻去游樂場玩時邂逅了一個仿佛處在另一個世界的人，她眼中看不見任何一個人，孤獨的魔法少女。售票員阻攔她坐摩天輪，但她直接從售票員身上穿過去了，栗木橘給她補了票。（重大伏筆）
栗木橘與迷生櫻參加了之前約好的演唱會，結(jié)束之后，發(fā)現(xiàn)星見純特地找他們有事情。
星見純告訴他們的一位朋友的父親被死亡的魔法少女殺害了，死因是心臟麻痹，請求他們援助，而這恰好是他們所需要的線索。
在受害人家中他們發(fā)現(xiàn)了一瓶有著濃厚魔法元素的藥劑——幸福之藥。
在經(jīng)過不斷地搜查之后發(fā)現(xiàn)了幸福之藥是一種類似于毒品的東西，使用后會讓人感受到?jīng)Q定的幸福，無法自拔。
追著這一條線索，他們反而距離夜神嵐的線索越來越遠，發(fā)現(xiàn)了一條販賣幸福之藥的產(chǎn)業(yè)鏈，他們也因此確定了下一個受害人的范圍。
之后他們一天遭遇了一位是普通人的魔法少女獵人，身上全幅武裝，身材魁梧，肌肉壯碩，但是是一個女人，她身邊跟著一位小跟班寄宿的魔法少女。她也是為了狩獵夜神嵐而來，目的是與栗木橘一致的。
寄宿的魔法少女的能力是讓自己寄宿于別人體內(nèi)，把普通人暫時變成強大的魔法少女。
小跟班只是擅自更著她，那個魁梧的女人對她很冷漠。那個魁梧女人的真實身份是被祝福的魔法少女所救下的女孩。
最后經(jīng)歷了種種戰(zhàn)斗，終于發(fā)現(xiàn)了夜神嵐的真實身份，并且得知了她行為的正確性，她以個人的名義去裁決被人類的法律與魔法少女的律法制裁不到的人，并不濫殺無辜。
但是栗木橘還是制止了她的行為，因為總有一天她正義的天平也會傾斜的。
偶像星見純的朋友的父親，發(fā)現(xiàn)是與偶像閃耀的魔法少女獅叢耀有往來。
而獅叢耀是屬于反魔法少女組織的，換句話說，這個幸福之藥與反魔組織有著脫不開的關(guān)系。
【第三卷】幸福之卷
經(jīng)過不斷地對幸福藥劑的研究，發(fā)現(xiàn)了幸福藥劑的來源是一個被魔法少女獨裁的地方，被機械的魔法少女所掌控的鋼鐵之城，而他們的下一個任務(wù)就是找到幸福藥劑的真正來源，并且找出反魔究竟在其中扮演了什么角色。
幸福的魔法少女本來是一個很純粹的人，看著苦難的人們，她想讓他們幸福，可是她的愿望被扭曲了，變成了一種之間讓他們精神幸福的能力，換句話說哪怕是街角里躺著的流浪漢，對他使用能力之后他也會幸福地就像是億萬富翁一樣，是精神的鴉片。
幸福的魔法少女的這一能力被發(fā)現(xiàn)后，她被機械的魔法少女逮捕了，將她囚禁來生產(chǎn)幸福之藥，獲得暴利。
鋼鐵之城是一座悲哀的城市，普通人被榨干價值隨意舍棄，貧民窟臟亂不堪，他們靠吸食幸福之藥來獲得精神上的安寧。
這片區(qū)域是人類與魔法少女勢力的盲區(qū)，因為機械的魔法少女為創(chuàng)造這座城市提供了一切，所以她擁有絕對的所有權(quán)，而那些人們隨時都可以從這里離開，但是他們的雙翼早就殘破不堪了。
栗木橘他們不斷深入發(fā)現(xiàn)真相，同時也遇到了唯一對抗他們的魔法少女，怪盜的魔法少女，在這個機械的魔法少女獨裁之下唯一反抗的力量。
最終他們一行人擊敗了機械的魔法少女醞釀的陰謀，發(fā)現(xiàn)了她也是反魔組織的支持者之一。
而在這個期間海底監(jiān)牢出現(xiàn)了意外，這座位于太平洋五千多米深的監(jiān)獄被反魔組織攻破了，其中最重要的破局點就是叛徒的獅叢耀。海底監(jiān)牢之中，被第一支隊隊長心瞳愛所擊敗的史上最惡魔法少女——詭異的魔法少女被釋放了出來，是少有墮落的S級魔法少女，她殺過的人不少于魔女，而她因為能力的特殊性無法殺死，只能被囚禁。
這時龍之魔女從鋼鐵之城，在栗木橘他們頭頂上飛過，是現(xiàn)今唯一沒有被殺死的S級魔女。
【第四卷】屠龍之卷
龍之魔女再度重現(xiàn)，讓第五支隊最后的成員憤怒不已，第五支隊的覆滅也是因為龍之魔女，而誅滅籠深感愧疚，因為這就是她魔女化后的形態(tài)、
誅滅籠知道討伐它就是屬于她的責(zé)任，那些死去的隊員也是因為她，而小舟影很害怕在戰(zhàn)斗中失去誅滅籠。
誅滅籠的第三支隊與主角團的第九支隊，以及新出場的第七支隊一起聯(lián)合去討伐龍之魔女。
同時在執(zhí)行任務(wù)的第八支隊，由白芷星領(lǐng)導(dǎo)的隊伍受到了詭異的魔法少女的襲擊。
哪怕有著三位S級魔法少女，但龍之魔女依然不落下風(fēng)，是強大到令人難以想象的魔女，在最后以小舟影與凜冬雪使用二階變身來束縛住了龍之魔女，影束加上凍結(jié)，最后給其他魔法少女創(chuàng)造出機會全力一擊最后消滅。
【第五卷】非魔之卷
跟隨著從機械的魔法少女那里取得的線索，指向了一個魔法少女的禁區(qū)。
在那里魔法少女是禁忌的存在，一旦闖入就會被像中世紀狩獵魔女一樣被獵殺，是世間明面上唯一一個不存魔法少女的地方。
那里貧窮而且落后，土地貧瘠難以生長作物，水源稀少，大多數(shù)人都在為了生存而忙碌，這里也有著最原始的信仰，一個被他們視作神明的存在。
那個神明本質(zhì)上就是一位極其強大的魔法少女，她可以感知到這片區(qū)域內(nèi)所有魔法少女的存在，并且大大削弱她們的魔力，讓她們虛弱到能被村民單方面虐殺。
而在這座村莊之中，有一位天然的魔法少女誕生了，哪怕她的姐姐一直都遮遮掩掩的，但終于還是被村民所發(fā)現(xiàn)，要作為祭品來獻給神明大人。
這時主角團也跟隨著線索踏入了這一片禁區(qū)，所有人的能力都被大大削弱，不過還沒能強大到影響S級魔法少女。
他們跟隨著游行的村民救下了將要被獻祭的女孩，同時也暴露了他們的身份。
最后他們找到了神明的真實身份，反魔法少女組織的成員，腐朽的魔法少女。
她告訴了主角團詭異的魔法少女真正的目的，是殺盡所有的魔法少女，這才是她們認為的唯一的救贖之路。
【第六卷】星辰之卷
白芷星與詭異的魔法少女交戰(zhàn)之后就失聯(lián)了，而主角團接下了支援她們的任務(wù)。
詭異的魔法少女極其強大，不僅僅她本身就有極強的戰(zhàn)斗能力，而且她還可以用魔力誕生出【詭異】來，每一個【詭異】都擁有獨特的特性，代表著她天馬行空的想象力，如果不好好研究特性而強行攻擊【詭異】的話，恐怕死都不知道怎么死的。
這世上也許有能力戰(zhàn)勝她的只有第一支隊隊長心瞳愛，被稱為史上最強的魔法少女。而心瞳愛則在執(zhí)行追尋魔女領(lǐng)域來源的任務(wù)，裁決者發(fā)現(xiàn)了一個異空間，是通過孤獨的魔法少女發(fā)現(xiàn)的，那里時間與空間都是混亂的，連接著過去與未來。
此刻第八支隊就被詭異的魔法少女設(shè)下的多個【詭異】所困住了，她們根本不敢輕舉妄動，【詭異】的力量強大到難以想象。
主角團與第八支隊合流之后，一同想方設(shè)法對抗【詭異】，在最后星星的魔法少女白芷星使用能力呼喚了星辰，一擊粉碎了一切，然后陷入了沉睡之中。
【第七卷】詭異之卷
終于主角團與反魔法少女組織的首領(lǐng)詭異的魔法少女面對面交流了，他們聊了各自對魔法少女的看法，對魔女的看法，對世界未來的看法。
這時候詭異的魔女誕生了，詭異的魔法少女與詭異的魔女同時作為敵人出現(xiàn)在了他們的眼前。
這是反魔法少女組織最大的陰謀，也是最后的底牌。
她將實現(xiàn)他們反魔法少女組織的理念，殺盡一切作為魔法少女的存在。
主角團與第八支隊難以抗衡，裁決者第二支隊，第三支隊，第四支隊，第六支隊，第七支隊先后前來支援。
這已經(jīng)是關(guān)乎魔法少女存亡的世間了，一旦讓她們把針對魔法少女的【詭異】擴散出去，全世界的魔法少女被都得為之陪葬，甚至包括創(chuàng)造者她們自己。
即使裁決者幾乎將有生力量都聚齊了，但依舊難以看見獲勝的希望，詭異的魔女太過于強大，根本不是與他們一個層次的存在。
在最后的絕望時刻，心瞳愛帶著粉絲光柱降臨到了她們面前，給予了詭異的魔女最后一擊。
心瞳愛的稱號是魔法少女的魔法少女，她的愿望是成為魔法少女，她是一位充滿了愛與正義的人，是絕對的正義的化身，可以說是最像魔法少女的魔法少女。
她有著魔法少女一樣的會說話的寵物，她穿著魔法少女一樣的粉絲裙擺，她帶著有著愛心的魔杖，甚至還會在攻擊時喊出招式的名字。
心瞳愛沒有任何特殊能力，她有的只有龐大到難以想象的魔力，現(xiàn)在裁決者剩下的七個隊長的魔力全部加起來都比不上她。
甚至不僅僅如此，甚至全部存在過的魔法少女的魔力加起來都比不上她，她也因此被稱為史上最強魔法少女。
【第八卷】心瞳之卷
擊碎了反魔法組織的陰謀，裁決者終于能夠深入去探究魔女領(lǐng)域究竟從何而來，經(jīng)過心瞳愛的探索，她已經(jīng)獲得了不少的情報量，她知道了異空間連接著未來，而在他們的未來誕生出了一個極其強大的魔女，強大的甚至能夠毀滅宇宙。
這個魔女就是一切魔女事情的元兇，只要將它討伐掉一切都結(jié)束了，但是這是完全難以想象的事情。
在栗木橘與凰羽杏詭異的魔女戰(zhàn)斗時候，他們都被毀滅過一次，在化為一地水銀的時候，栗木橘拂去凰羽杏的淚水，說她做的一切已經(jīng)夠，她已經(jīng)再也不用戰(zhàn)斗下去了，她的一切都將由栗木橘來承擔(dān)，她的愿望將由他來實現(xiàn)。
最后凰羽杏變成了普通人，而栗木橘成為了真正的朱雀的魔法少女。
心瞳愛想要一個人進入異空間面對未來所有的魔女，其他人都想幫忙但都被拒絕了，但她卻主動要求栗木橘一同前往。
所以最后的結(jié)果是，心瞳愛與栗木橘獨自二人將要面對未來所有誕生的魔女，以及那個強大到難以置信的魔女。
進入未來之后，那里是一個只存在著魔女的世界，這時栗木橘才領(lǐng)教了心瞳愛真正的強大之處，在這里她也消除了一切顧及，毫無保留地輸出。
她哪怕獨自面對成千上萬的魔女都不落下風(fēng)，整個地球的地表都被她的攻擊所覆蓋。
在這聲勢浩大的攻擊中，那位宇宙級別的魔女醒來了，僅僅一瞬間心瞳愛就被消滅了。
但心瞳愛早就對此做出了準備，她知道她將會在這里死去，而她知道唯一有希望戰(zhàn)勝一切魔女的人只有主角栗木橘，她的目的就是給栗木橘創(chuàng)造出機會來。
栗木橘是命運之子。
【第九卷】命運之卷
視角轉(zhuǎn)換，這一卷將從上一個世界講起，這是一個有丘比存在的，會有魔女誕生的普通世界，在這個世界里魔法少女是要簽訂下契約才會誕生的。
在這個世界里栗木橘有著一個妹妹栗木虹，他們的關(guān)系很親密，經(jīng)常膩在一起玩耍。
但有一天栗木橘突然死去了，這個世界是沒有栗木橘的世界。
栗木虹在悲傷之后還是堅強地活了下去，她有了幾位魔法少女的朋友，其中就有成為朱雀的魔法少女的凰羽杏。
魔女越來越強大，魔法少女越來越難以抵抗，人類血流成河，建筑殘破不堪，所有人都在痛苦掙扎著，世界一步步走向毀滅。
魔法少女一位又一位絕望變成了魔女，希望已經(jīng)渺茫到難以看見，即使到了這一刻栗木虹都沒能許下愿望成為魔法少女。
到最后就剩下了個位數(shù)的魔法少女，其中就包括兔尾桃，凰羽杏，心瞳愛。
但最后已經(jīng)是翻盤無望，人類的文明完全毀滅，最后凰羽杏與心瞳愛也陷入了絕望，化作了極為強大的魔女。
栗木虹終于向丘比許下了愿望，讓世界重塑，讓魔女這一存在誕生于無限遠的時間里。
她沒有能力讓魔女這個存在消失，所以她的愿望是一種貸款，讓魔女誕生于人類文明自然毀滅之后，也許是幾億年，但對于宇宙的壽命來說是滄海一粟，這樣至少能夠保證人類能夠無慮地活著。
丘比雖然不能即使得到魔女的能源，但是它終究會在宇宙熱寂前得到這份能源，所以對丘比來說也是合理的買賣。
栗木虹最后成為了命運的魔法少女，主宰了全人類，全魔法少女的命運，在命運的牽引下，哪怕世界出現(xiàn)了巨大的變動，哪怕魔女這存在，丘比這一存在都被完全抹去，世界依然還是按照命運注定的那樣運作著。
一切被魔女所傷害過的人都會以各種意外死去，世界的運行還是像曾經(jīng)一樣，所有該誕生的魔法少女還是照樣誕生，唯一的節(jié)點變動在世界滅亡的時刻，這里早就沒有了人類存在，所以也就不存在命運，在這個時間世界將誕生出全新的命運來。
也就是說哪怕過去還是那樣，這個新世界之中人類是擁有未來的，由栗木虹所創(chuàng)造出的未來。
栗木虹創(chuàng)造出了全新的宇宙，一個為了人類而創(chuàng)造的宇宙，她在最后完成了她一直渴望的事情，就是在這個新世界中救下她的哥哥栗木橘。
世界中能夠超脫于命運枷鎖之外的只有她自己——命運的魔法少女。
所以最后栗木虹將自己的權(quán)能交給了自己的哥哥，讓他破除了自己死去的命運，在這個新世界中存活了下來，并且讓他擁有改變命運的力量。
而她也將在這個新世界中永遠消失不見，這個世界中的另一個她沒能從母親身體之中誕生。
栗木橘從一開始就隱藏著魔法少女的能力，命運的魔法少女，是唯一能夠改變預(yù)知的魔法少女——迷生櫻所遇見的未來。
【第十卷終卷】絕對絕望之卷
那位宇宙級別的魔女的本體，并不是栗木橘陌生的人，反而是他最為熟悉的人之一——兔尾桃。
在初始的世界之中有一個人類一直沒有絕望，或者說是不能進入絕望的狀態(tài)，那就是兔尾桃，因為她更像是一種規(guī)則的存在。
她是以“普通人”身份存在的，一切外部的影響都對她無效，在這個完全毀滅的世界之中，她獨自地存活著。
兔尾桃戴上了金色的面具，身上披滿了魔法少女的嘆息之種，與剩下所有的魔女做著對抗，直至殺盡了地球上最后一位魔女。
在無盡的歲月長河之中，她就這樣以人類的姿態(tài)一直存活了下去，這個只有她存在的寂寞的星球，她將一直陪伴到宇宙終結(jié)。
但在新世界之中一切都改變了，新世界之中過往存在過的魔女沒有一位被消滅，全部被栗木虹轉(zhuǎn)移到了很遠很遠的未來，在那個未來時刻人類與魔法少女本該早就消亡了。
而兔尾桃卻在那個時代存在著，所有魔女都聚集的璀璨時刻。
這一次她的抗爭輸了，就像是迷生櫻的預(yù)言那樣，世界只剩下了一位勇士，對抗全世界的勇士，但在最終她還是陷入了絕望。
兔尾桃最終成為了魔女，但是她又從魔女轉(zhuǎn)變成了普通人，恢復(fù)了自己的意識。
在她轉(zhuǎn)變之中能量誕生了。
她成為了絕望之魔女，但依然保留著自己的意識與其他魔女做著抗爭，然后又陷入了絕望之中，再度魔女化，然后又變成了普通人。
新的能量又誕生了。
兔尾桃一人獨自對抗著所有歷史之中存在過的魔女，一次次陷入絕望，但又一次次恢復(fù)意識，并且為宇宙的衰敗增添上能量。
到最后，兔尾桃獨自一人消滅了所有地球上存在過的魔女，而她自己所誕生的能量已經(jīng)強大到能夠重塑一整個星系。
但是她也陷入了真正的絕望之中，成為了絕對絕望魔女，她僅有的意識在無止盡的魔女化之中漸漸消散了。
兔尾桃每一瞬間都在絕望之后恢復(fù)，而又在恢復(fù)之后絕望，能量源源不斷地從兔尾桃體內(nèi)誕生，她一人甚至強于了全宇宙的魔女。
到了最后兔尾桃甚至已經(jīng)強大到能夠創(chuàng)造宇宙，并且她擁有了所有魔法少女的權(quán)能，她一人即是宇宙，無限大的宇宙。
她將超越一切法則，一切規(guī)則，超越時間，超越空間而存在。
兔尾桃在一瞬之間創(chuàng)造了無限數(shù)量的宇宙，在無限數(shù)量的宇宙之中又誕生了無限數(shù)量的自己，而無限數(shù)量的兔尾桃每一個都將創(chuàng)造出無限數(shù)量的宇宙來，如此循環(huán)反反復(fù)復(fù)。
誕生的每一個兔尾桃下一刻比起上一刻將會擁有無限倍力量的提升，速度的提升，數(shù)量的提升……兔尾桃無限種權(quán)能都將無限倍提升，在提升之后將會下一刻擁有上一刻的無限倍數(shù)量的權(quán)能，如此循環(huán)反反復(fù)復(fù)。
到最后每一個兔尾桃都將能瞬間毀滅她所創(chuàng)造出來一切，她成為了一種超脫一切的不可名狀之物。
但是這樣的兔尾桃在哭泣著，她一直在等待著一位把她從這個絕望之中拯救出來的人。
栗木橘使用從祝福魔女中獲得而來的生命容器——賢者之石，許下了栗木橘的愿望，將本該不存在于這個世界的丘比召喚了出來，賢者之石破碎。
最后栗木橘在丘比面前，以他朱雀的魔法少女的身份，命運的魔法少女的身份，作為與兔尾桃命運相連的身份，以及作為普通人的身份許下了愿望。
他的因果與上一個世界，以及這一個世界都聯(lián)系在了一起，他的因果從過去到現(xiàn)在都聯(lián)系在了一起。
“我想要拯救兔尾桃，讓她從絕望中擺脫出來?！崩跄鹃儆昧俗钯|(zhì)樸的話語許下了愿望。
這個愿望針對任何普通人都可以輕而易舉的實現(xiàn)，但是對于兔尾桃這個已經(jīng)不可描述的存在來說難如登天。
這個愿望真的會實現(xiàn)嗎？丘比想著，這個事情的發(fā)展已經(jīng)完全不受它控制了，它只想賺點能量延長宇宙的壽命，沒想著創(chuàng)造出一個能夠創(chuàng)造宇宙的存在出來啊。
在浩瀚的宇宙之中，閃耀的群星之下，一對赤裸的男女擁抱在一起，在太空之中飄蕩著，就像每一粒塵埃一樣。
沒有人知道這兩個在無垠的宇宙面前如此渺小的存在，竟然會是無數(shù)個宇宙的創(chuàng)世神。
“你來救我了。”那位少女說道，淚水從眼角落下，在太空之中變成了飄蕩的珍珠。
“嗯，一切都結(jié)束了，我們回去吧，回到最開始的地方去?！鄙倌昃o緊摟住了少女。
栗木橘從睡夢中醒來，發(fā)現(xiàn)有一個陌生的女孩在和他在同一個被窩里，緊緊地摟著他，睡著很安穩(wěn)。
哪怕他是第一次見到這個女孩，但這種熟悉的感覺已經(jīng)讓他知道了這個女孩的身份，是他的親生妹妹栗木虹。
他雖然很小心地起身了，但還是驚醒了栗木虹，栗木虹剛醒來的樣子還是迷迷糊糊的，下意識地就在栗木橘身上撒嬌起來。
他這個狹小的公寓內(nèi)出奇地?zé)狒[，迷生櫻向往常一樣用手柄噼里啪啦地打著游戲，而拿著另一個手柄的半月梨也不甘示弱，兔尾桃則穿著女仆裝給她們做著點心，而一旁的凰羽杏也在幫忙。
栗木橘拿起了手機，發(fā)現(xiàn)全是鹿枝灰給他發(fā)的一些沒營養(yǎng)的消息，讓栗木橘情不自禁地露出了笑容。
心瞳愛坐在栗木橘的床沿上，輕輕地在耳邊說道：“你終于醒了，我的救世主大人?！?p> 《醒來成為魔法少女》——全書終